Biologisk Institut ved Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, søger en Sequencing Platform and Service Manager med start den 1. december 2026.
Om stillingen
Ved Sektion for Mikrobiologi arbejder Københavns Universitet, BRIC for at forstå og udnytte den enorme funktionelle diversitet og det adaptive potentiale i naturlige mikrobielle samfund. Dette gøres ved hjælp af avancerede molekylære teknikker, herunder high-throughput DNA-sekventering, cellesortering, single-cell detektion og realtids biofilmformation på Bioflux-centret.
Opgaver
Stillingen omfatter koordinering af sekventeringsoperationer og laboratoriearbejdsgange i en bredere rolle, der kombinerer serviceledelse, metodeudvikling, datastyring, kundekoordinering, teknisk rådgivning og platformadministration.
Dine opgaver vil omfatte:
- Håndtering af sekventeringstjenestekontrakter, herunder koordinering med interne og eksterne interessenter og opfølgning på tjenesteydelsen.
- At fungere som primær kontaktperson for leverandører af sekventeringsplatforme og koordinere tekniske og operationelle anliggender relateret til platformene.
- Udvikling og implementering af nye analyseprotokoller, herunder arbejdsgange for 16S-sekventering og -analyse ved hjælp af PacBio.
- At tage ansvar for lagring, organisering, styring og tilgængelighed af sekventeringsdata.
- Udførelse og overvågning af datarensning og -forberedelse som en del af sekventerings- og analysearbejdsgangen.
- At fungere som direkte kontaktperson for eksterne kunder og samarbejdspartnere, herunder koordinering af sekventeringsanmodninger, krav, tidsplaner og tekniske spørgsmål.
- Udvikling, opdatering og vejledning i laboratorie- og sekventeringsprotokoller for at sikre konsekvente procedurer og kvalitet.
- Teknisk rådgivning til servicebrugere og kolleger om DNA-relaterede teknikker, prøveforberedelse, sekventeringskrav og fejlfinding.
Københavns Universitet, BRIC forventer
- En relevant kandidatgrad eller tilsvarende akademisk kvalifikation inden for for eksempel mikrobiologi, molekylærbiologi, bioteknologi, biokemi, bioinformatik eller et beslægtet felt.
- Praktisk erfaring med molekylærbiologi og DNA-baserede laboratoriemetoder, herunder DNA-ekstraktion, prøveforberedelse, PCR og sekventeringsarbejdsgange.
- Erfaring med next-generation sekventeringsteknologier og fortrinsvis både short-read og long-read sekventeringsmetoder.
- Erfaring med eller kendskab til amplikonsekventering, især 16S rRNA-gen-sekventering. Erfaring med PacBio-sekventering er en fordel.
- Erfaring med håndtering, kvalitetskontrol, organisering og styring af sekventeringsdata.
- Erfaring med koordinering af tekniske tjenester, laboratoriearbejdsgange, forskningsinfrastruktur, platforme eller projekter.
- Evnen til at rådgive forskere og servicebrugere om tekniske spørgsmål og oversætte videnskabelige krav til praktiske arbejdsgange.
- Gode IT- og datastyringsfærdigheder. Erfaring med bioinformatiske arbejdsgange eller sekventeringsdataanalyse er en fordel.
- Gode skriftlige og mundtlige kommunikationsevner på engelsk.
Københavns Universitet, BRIC tilbyder
Københavns Universitet, BRIC tilbyder en selvstændig og varieret stilling i et internationalt orienteret forskningsmiljø. Her får du mulighed for at bidrage direkte til udvikling og drift af sekventeringstjenester og forskningsinfrastruktur.
Du vil arbejde tæt sammen med forskere, teknisk personale, studerende, eksterne samarbejdspartnere, servicebrugere og teknologileverandører. Du vil også få mulighed for at udvikle din ekspertise inden for sekventeringsteknologier, laboratorie- og analysearbejdsgange, datastyring og forskningsinfrastrukturledelse.
Sektion for Mikrobiologi tilbyder et samarbejdsorienteret arbejdsmiljø med adgang til avancerede teknologier og forskningsaktiviteter. Disse spænder over mikrobiel økologi, mikrobiomics, mikrobielle interaktioner, miljømikrobiologi og relaterede områder.
Ansættelsessted
Ansættelsesstedet er Sektion for Mikrobiologi, Biologisk Institut, Københavns Universitet. Københavns Universitet, BRIC tilbyder kreative og stimulerende arbejdsforhold i et dynamisk og internationalt forskningsmiljø.
Løn- og ansættelsesvilkår
Stillingen er en fuldtidsstilling med en gennemsnitlig arbejdstid på 37 timer om ugen. Stillingen er en tidsbegrænset ansættelse på 1 år. Startdatoen er den 1. december 2026 eller efter aftale.
Ansættelse vil ske som specialkonsulent i henhold til Cirkulære om overenskomst for akademikere i staten. Denne er indgået mellem Finansministeriet og Akademikerne. Der vil være mulighed for at forhandle tillæg baseret på kvalifikationer. Du kan læse mere om lønniveauer i staten på www.loenoverblik.dk.
Din ansøgning
Hvis du er interesseret i stillingen, bedes du sende din elektroniske ansøgning, inklusive bilag, via Københavns Universitets jobportal.
Din ansøgning skal omfatte:
- Motiveret ansøgning, der adresserer kravene (maks. én side).
- Curriculum Vitae (CV)
- En certificeret/underskrevet kopi af uddannelsesbevis(er).
Ansøgningsfristen er den 22. oktober 2026.
Samtaler vil finde sted i uge 43-44.
Københavns Universitet stræber efter at afspejle samfundet og opfordrer alle til at søge, uanset personlig baggrund.
Yderligere spørgsmål
Eventuelle spørgsmål om stillingen kan rettes til professor Søren Johannes Sørensen på sjs@bio.ku.dk.
Københavns Universitet har etableret en ny fælles administrativ struktur, som stadig er under implementering. Dette medfører løbende ændringer og udvikling af blandt andet arbejdsprocesser og samarbejdsområder.
