Postdoctoral position in functional ancient microbial ecogenomics within the Ancient Environmental Genomics Initiative for Su...

Sektion for Geogenetik, Globe Institute, Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet.

Den Ancient Environmental Genomics Initiative for Sustainability (AEGIS) inviterer ansøgere til tre toårige post doc-stillinger inden for funktionel ældgammel mikrobiel økologi med start den 1. november 2026 eller hurtigst muligt derefter. KU - SCIENCE - SNM søger én forsker inden for hvert af følgende tre områder: computational ancient metabolomics og naturprodukter, kulhydrataktive enzymer og kulhydratmetabolisme samt proteinsprogmodeller til ancient metagenomics.

AEGIS er et banebrydende forskningscenter ledet af professor Eske Willerslev. Centret samler et tværfagligt og internationalt team af verdensførende forskningsgrupper med en fælles vision om at udvikle mere robuste, bæredygtige og biodiverse afgrøder og landbrugspraksis for at mindske klimaforandringernes effekt på den globale fødevareproduktion: https://novonordiskfonden.dk/en/news/climate-resilient-crops-novo-nordisk-foundation-and-the-wellcome-trust-award-a-grant-of-up-to-dkk-585-million-to-the-ancient-environmental-genomics-initiative-for-sustainability/

AEGIS kombinerer ældgammel miljø-DNA, genomik, metagenomik, informatik og biostatistik, evolutionsbiologi, økologi, geologi, arkæologi, planteteknik og forskning i landbrugsafgrøder. KU - SCIENCE - SNM vil indsamle og arbejde med geologiske sedimenter, knogler, fossiler og materiale fra nutidige arter fra mere end 200 lokationer verden over for at generere og analysere enorme mængder af ældgammel og nutidig miljø-DNA og andre ældgamle og moderne biomolekylære data sammen med tilhørende kontekstuelle data.

De annoncerede stillinger er inden for Microbial EcoGenomics Group ved Center for Ancient Environmental Genomics. Gruppen udnytter ældgammel DNA (aDNA) til at rekonstruere tidligere mikrobielle økosystemer, forstå langsigtede biodiversitetsdynamikker og innovere beregningsmetoder til analyse af ældgamle mikrobielle data.

KU - SCIENCE - SNM værdsætter mangfoldighed og inklusivitet i KU - SCIENCE - SNM's forskningsmiljø. KU - SCIENCE - SNM opfordrer aktivt til ansøgninger fra personer med alle baggrunde, identiteter og erfaringer, der deler KU - SCIENCE - SNM's engagement i at adressere globale miljøudfordringer gennem innovativ forskning.

Som post doc-forsker skal du analysere store datasæt af ældgammel miljø-DNA (aeDNA), genereret via high-throughput sekventeringsteknologier. Du skal undersøge, hvordan mikroorganismers funktionelle potentiale har ændret sig over tid og rum. Målet er at forstå, hvilke mikroorganismer der var til stede i tidligere økosystemer, hvilke funktioner de kunne udføre, og hvordan disse funktioner ændrede sig over tid.

De tre stillinger vil adressere dette ved at studere kulhydrataktive enzymer, biosyntetiske genklynger og naturprodukter samt ved at udvikle proteinsprogmodeller til funktionel annotering af ældgamle metagenomer.

Sammen vil disse områder hjælpe KU - SCIENCE - SNM med at undersøge, hvordan tidligere mikrobielle samfund brugte organisk materiale og producerede forbindelser involveret i interaktioner mellem mikroorganismer, planter og deres omgivelser. Arbejdet med ældgammel metabolomik og naturprodukter vil fokusere på beregningsmæssig analyse af biosyntetiske gener og veje, med analyse af metabolomikdatasæt hvor tilgængeligt.

Arbejdet med kulhydratmetabolisme vil undersøge CAZymes og associerede veje i ældgamle og moderne metagenomer. Proteiniske sprogmodeller vil blive brugt til at forudsige funktionerne af proteiner genfundet fra ældgammel DNA, herunder ufuldstændige og dårligt karakteriserede sekvenser, og understøtte disse analyser.

Dine ansvarsområder vil omfatte udvikling af beregningsmæssige og statistiske metoder til at studere mikrobielle funktioner i ældgamle metagenomiske data. Du vil arbejde sammen med de andre post doc-forskere og kolleger på tværs af AEGIS for at evaluere funktionelle forudsigelser og fortolke dem i en økologisk og evolutionær kontekst.

KU - SCIENCE - SNM søger tre forskere med erfaring inden for ældgammel metagenomik og ekspertise relevant for et af de tre forskningsområder. Ansøgere forventes ikke at have ekspertise inden for alle tre områder.

• Du har en ph.d. i bioinformatik, genomik, samfundsøkologi, beregningsbiologi, beregningsmetabolomik eller et beslægtet felt.
• Du har erfaring med at analysere store ældgamle metagenomiske datasæt.
• Du har erfaring med at undersøge mikrobielle gener, metaboliske veje, funktionelle træk eller processer på samfundsniveau i en økologisk eller evolutionær kontekst.
• Du har erfaring med analyse af ældgammel eller nedbrudt DNA, herunder autentificering og analyse af lavt forekommende og fragmenterede sekvensdata.
• Til proteinsprogmodelstillingen har du erfaring med at implementere og evaluere maskinlæringsmodeller for proteinsekvenser.
• Stærke analytiske færdigheder og en interesse i tværfaglig forskning.
• Fremragende kommunikationsevner og evne til at arbejde i teams.
• Fremragende engelskkundskaber, både skriftligt og mundtligt.

• Erfaring med beregningsmetabolomik, bioinformatik inden for naturprodukter eller analyse af biosyntetiske genklynger; CAZyme-annotering eller mikrobiel kulhydratmetabolisme; eller proteinsprogmodeller og proteinfunktionsforudsigelse, afhængigt af den stilling der ansøges om.
• Computational færdigheder, herunder færdigheder i R, Python eller andre relevante programmeringssprog.
• Erfaring med at arbejde i high-performance computing (HPC) miljøer.
• Stærkt videnskabeligt CV med publikationer i peer-reviewede internationale tidsskrifter som førsteforfatter inden for feltet mikrobielle samfund og/eller bioinformatik, genomik, økologisk modellering, ældgammel DNA eller lignende.
• Erfaring med startups, entreprenørskab eller innovation, især omsættelse af akademisk forskning og videnskabelige resultater til kommercielt relevante applikationer eller startup-virksomheder.

Arbejdsstedet er Globe Institute, Sektion for Geogenetik (Øster Voldgade 5-7, 1350, København), Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet.

Globe Institute er en del af Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet ved Københavns Universitet. Instituttets hovedformål er at besvare grundlæggende videnskabelige spørgsmål gennem tværfaglige tilgange. Instituttet opererer i krydsfeltet mellem natur- og sundhedsvidenskab samt humaniora. Information om instituttet kan findes på: http://www.globe.ku.dk/.

Globe Institute er forpligtet til at skabe et inkluderende og mangfoldigt miljø, hvor medarbejdere og studerende kan føle sig hjemme og trives. Se hjemmesiden for mere information. Alle kvalificerede ansøgere vil modtage fuld overvejelse. Kandidater, der gennem deres forskning, undervisning og/eller service bidrager til mangfoldigheden og kompetencerne i KU - SCIENCE - SNM's Institut, opfordres til at søge. Københavns Universitet stræber efter at tilbyde et familievenligt og fleksibelt arbejdsmiljø med en bæredygtig balance mellem arbejde og privatliv, herunder barselsordninger (op til 47 uger for begge forældre) og op til seks ugers betalt ferie om året. Forskere, der ikke har været skattepligtige i Danmark de seneste 10 år, kan ansøge om en særlig (reduceret) skatteordning. Universitetet tilbyder en række ydelser til internationale forskere og medfølgende familier.

Den gennemsnitlige ugentlige arbejdstid er 37 timer om ugen.

Stillingen er en tidsbegrænset ansættelse på 2 år. Startdatoen er den 1. november 2026 eller hurtigst muligt derefter.

Stillingen er omfattet af aftalen om stillingsstruktur for videnskabeligt personale.

Ansættelses- og aflønning sker i henhold til overenskomsten mellem Finansministeriet og Akademikerne i staten.

Der vil være mulighed for at forhandle tillæg baseret på kvalifikationer. Du kan læse mere om lønniveauer i staten på www.loenoverblik.dk.

For yderligere information bedes du kontakte Antonio Fernandez-Guerra: antonio.fernandez-guerra@sund.ku.dk.

Udenlandske ansøgere kan finde dette link nyttigt: www.ism.ku.dk (International Staff Mobility).

Indsend din online ansøgning på engelsk ved at klikke på ‘Ansøg nu’ nedenfor. Ydermere skal din ansøgning indeholde følgende dokumenter/vedhæftninger – alt i PDF-format:

1. Motiveret ansøgning (maks. én side), der angiver hvilket forskningsområde du ansøger om, og beskriver din relevante erfaring.
2. CV inkl. uddannelse, arbejds-/forskningserfaring, sprogfærdigheder og andre færdigheder relevante for stillingen.
3. En bekræftet/underskrevet kopi af a) ph.d.-bevis og b) kandidatbevis. Hvis ph.d.'en ikke er afsluttet, er en skriftlig erklæring fra vejlederen tilstrækkelig.
4. Publikationsliste.

Ansøgningsfrist: 27. september 2026, kl. 23.59 CET.

KU - SCIENCE - SNM forbeholder sig retten til ikke at behandle materiale modtaget efter fristens udløb og ikke at behandle ansøgninger, der ikke opfylder ovenstående krav.

Efter fristens udløb udvælger den autoriserede rekrutteringsansvarlige ansøgere til bedømmelse efter indstilling fra ansættelsesudvalget. Alle ansøgere får herefter omgående besked, om deres ansøgning er sendt til bedømmelse hos en uvildig bedømmer. Når bedømmelsesarbejdet er afsluttet, får hver ansøger mulighed for at kommentere den del af bedømmelsen, der vedrører ansøgeren.

Du kan læse om rekrutteringsprocessen på http://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/.

Ansøgeren vil blive bedømt i henhold til bekendtgørelse nr. 242 af 13. marts 2012 om ansættelse af videnskabeligt personale ved universiteter.

Københavns Universitet ønsker at afspejle samfundets mangfoldighed og opfordrer alle kvalificerede kandidater til at søge uanset personlig baggrund.