Postdoc Position in Mass Spectrometry for Palaeoproteomics

Hos KU - SCIENCE - SNM søger Palæoproteomik-forskningsgruppen, ledet af professor Enrico Cappellini, en yderst kompetent, motiveret og dynamisk postdoc. Den ideelle kandidat skal have dokumenteret erfaring inden for massespektrometri (MS) anvendt til (palæo)proteomisk forskning. Stillingen er en tidsbegrænset fuldtidsansættelse på 2 år (24 måneder), der begynder den 1. januar 2027 eller snarest derefter.

Den udvalgte kandidat vil bidrage til udviklingen af nye arbejdsgange inden for prøveforberedelse, kromatografi og MS-baseret analyse. Disse arbejdsgange er designet til at øge genfindelsen af ældgamle peptider fra progressivt ældre prøver, samtidig med at mængden af prøvet ældgammelt materiale minimeres. Specifikt skal den udvalgte kandidat udvikle og optimere MS-løsninger for at maksimere længden og kvaliteten af millionårgamle aminosyresekvenser, hvilket vil muliggøre mere præcise fylogenetiske rekonstruktioner.

Yderligere information om instituttet kan findes på https://globe.ku.dk.

Forskning hos KU - SCIENCE - SNM

Genfindelsen af ældgamle proteinspor, der bærer genetisk information fra fossile taksa, bliver stadig mere relevant inden for palæontologi og palæoantropologi. KU - SCIENCE - SNM's gruppe, i tæt samarbejde med proteomik-forskningsgruppen ledet af professor Jesper V. Olsen (JVO), også en del af Københavns Universitet, udvikler og anvender nye MS-baserede proteomiske metoder. Disse metoder bruges til at sekventere millioner år gamle proteiner, hvilket i øjeblikket repræsenterer den eneste kilde til genetisk information ud over grænserne for bevaring af ældgammelt DNA.

KU - SCIENCE - SNM bruger derefter denne information til at definere den fylogenetiske position af en række uddøde hominide arter fra Asien og Afrika, hvis fossiler er op til omkring 2-3 millioner år gamle. Iver og høj evne til at samarbejde med andre laboratorieforskere, specialister inden for computational palæoproteomik, palæontologer og palæoantropologer både inden for og uden for Københavns Universitet er nøglekrav til stillingen.

Den succesfulde kandidat vil indgå i et tværfagligt miljø, der spænder over palæoantropologi, evolutionsbiologi, arkæologi og massespektrometri. Miljøet giver adgang til Globe Instituttets højtydende computerklynge, avanceret proteomik-ekspertise og aktive nationale og internationale samarbejder.

Stillingens indhold

KU - SCIENCE - SNM stræber efter at fremme palæoproteomisk forskning ved at øge genfindelsen af ældgamle proteinspor fra ældre palæoantropologiske og palæontologiske fossile rester. Disse stammer ofte fra geografiske områder og geologiske kontekster, der er ugunstige for biomolekylær bevaring.

For at opnå dette fælles mål vil kandidaten primært fokusere på at etablere nye MS-metodologier. Disse metoder skal (i) maksimere genfindelsen af ældgamle proteiner fra fossile knogle- og tænderprøver, der generelt er ældre end 1 million år, og (ii) screene store sæt af morfologisk ikke-informative isolerede fossile fragmenter af knogler og tænder for at identificere art og køn på den organisme, de stammer fra.

Mere specifikt vil opgaverne, i tæt samarbejde med proteomik-forskningsgruppen ledet af professor Jesper V. Olsen, omfatte: (i) optimering af prøveforberedelse, (ii) design, test og implementering af kromatografi og højfølsomme massespektrometri-løsninger til PRM-, DDA- og DIA-måling, specielt designet til at genfinde multi-millioner år gamle proteinspor, og (iii) dataanalyse for at validere kvaliteten og ægtheden af de rekonstruerede aminosyresekvenser.

Yderligere ansvarsområder vil inkludere dybdegående involvering i de palæontologiske og palæoantropologiske forskningsprojekter udviklet i gruppen. Desuden skal kandidaten håndtere gruppens vådlaboratorieressourcer og bidrage til gruppens træningsaktiviteter. Dette indebærer både undervisning i universitetskursusmoduler og medvejledning af ph.d.-stipendiater og kandidatstuderende tilknyttet gruppen.

Profil

KU - SCIENCE - SNM søger en yderst kompetent, motiveret og dynamisk postdoc med en solid forskningsbaggrund inden for massespektrometri (MS) anvendt på proteiner eller andre organiske molekyler. Det er ideelt, hvis kandidaten har dokumenteret erfaring inden for MS-baseret (palæo)proteomik.

Den ideelle kandidat bør have følgende kompetencer og erfaring:

Væsentlig erfaring og færdigheder:

• Ph.d. i bioteknologi, analytisk kemi, biokemi, molekylærbiologi, biomolekylær arkæologi eller et relateret fagområde.
• Dokumenteret praktisk erfaring med betjening af højopløsnings LC-MS-instrumenter til proteomiske, peptidomiske eller organiske forbindelser.
• Dokumenteret færdighed i at designe, optimere, teste og validere LC-MS-arbejdsgange.
• Dokumenteret erfaring med computerbaseret behandling og fortolkning af LC-MS proteomiske/peptidomiske outputfiler ved hjælp af specialiseret bioinformatiksoftware som MaxQuant, PEAKS, Skyline eller sammenlignelige værktøjer.
• Fremragende kommunikationsevner og evnen til at interagere med flere teams både inden for og uden for Københavns Universitet.
• Fremragende skriftlige og mundtlige engelskkundskaber.
• Gode organisatoriske og analytiske færdigheder samt evnen til at overholde stramme deadlines.
• Proaktiv, fleksibel og problemløsende indstilling.
• Fremragende evner til multitasking og prioritering.
• Evne til at udføre opgaver på en struktureret, systematisk måde og med en høj grad af autonomi.
• Villighed til lejlighedsvis at rejse inden for og uden for Europa.

Ønskelig erfaring og færdigheder:

• Dokumenteret erfaring med udvikling og implementering af MS-baserede analysearbejdsgange specifikt for palæoproteomik.
• Erfaring med forberedelse af MS-prøver fra arkæologiske og ældgamle rester af forskellig art (f.eks. knogler, tænder, tandsten).
• Undervisnings- eller vejledningserfaring inden for palæoproteomik eller relaterede analytiske felter.
• Dokumenteret erfaring med at publicere resultaterne af egen forskning som (med-)ledende forfatter.
• Dokumenteret erfaring med at skrive og udføre kommandolinjescripts, f.eks. ved brug af "R"-sproget, til statistisk dataanalyse.
• Dokumenteret erfaring med at skrive konkurrencedygtige legatansøgninger eller forskningsmidler.

Arbejdssted

Arbejdsstedet er Globe Institute, Københavns Universitet, Øster Voldgade 5-7, 1350 København. KU - SCIENCE - SNM tilbyder kreative og stimulerende arbejdsforhold i et dynamisk og internationalt forskningsmiljø. Globe Instituttets molekylærbiologiske laboratorier er en central laboratoriefacilitet for forskningsgrupperne ved instituttet.

Faciliteten er opdelt i et dedikeret rent laboratorium, udelukkende beregnet til ældgamle biomolekyler som DNA og proteiner, og et generelt molekylærbiologisk laboratorium på separate steder. De rene laboratorier er yderligere opdelt i humane og ikke-humane sektioner. Laboratorierne har positivt tryk af filtreret luft, luftsluser, UV-lys mv., og alt arbejde udføres i helkropsdragter, der beskytter laboratorieprodukterne.

Massespektrometri-platformen i professor Jesper V. Olsens laboratorium er udstyret med verdensførende teknologi. Platformen yder teknisk support og vedligeholdelse til Proteomics Programmet og analytisk proteomik-støtte til CPR-forskningsgrupper.

Om Globe Institute

Globe Institute er en del af Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet ved Københavns Universitet. Instituttets hovedformål er at besvare grundlæggende videnskabelige spørgsmål gennem tværfaglige tilgange. Instituttet opererer i krydsfeltet mellem natur- og sundhedsvidenskab samt humaniora. Information om instituttet kan findes på: https://globe.ku.dk.

Globe Institute er engageret i at skabe et inkluderende og mangfoldigt miljø, hvor medarbejdere og studerende kan føle sig hjemme og trives. Se instituttets hjemmeside for mere information. Alle kvalificerede ansøgere vil blive fuldt ud overvejet. Kandidater, der gennem deres forskning, undervisning og/eller service bidrager til instituttets mangfoldighed og kompetencer, opfordres til at søge.

Københavns Universitet stræber efter at tilbyde et familievenligt og fleksibelt arbejdsmiljø med en bæredygtig balance mellem arbejds- og privatliv. Dette inkluderer barselsordninger (op til 47 uger for begge forældre) og op til seks ugers betalt ferie om året. Forskere, der ikke har været skattepligtige i Danmark inden for de seneste 10 år, kan ansøge om en særlig (reduceret) skatteordning. Universitetet tilbyder en række ydelser til internationale forskere og medfølgende familier.

Ansættelsesvilkår

Stillingen er omfattet af aftale om stillingsstruktur for videnskabeligt personale. Ansættelses- og aflønningsvilkår sker i henhold til overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikerne i staten.

Forhandling om løntillæg er mulig. Man kan læse mere om lønniveauer i den statslige sektor på www.loenoverblik.dk.

Spørgsmål

For yderligere information kan Enrico Cappellini kontaktes på ecappellini@sund.ku.dk.

Udenlandske ansøgere kan finde dette link nyttigt: www.ism.ku.dk (International Staff Mobility).

Ansøgningsprocedure

Ansøgningen skal indsendes online på engelsk ved at klikke på 'Ansøg nu' nedenfor. Desuden skal ansøgningen indeholde følgende dokumenter/vedhæftninger – alle i PDF-format:

1. Motiveret ansøgning (maks. én side).
2. CV inkl. uddannelse, arbejds-/forskningserfaring, sprogfærdigheder og andre relevante færdigheder for stillingen.
3. En certificeret/underskrevet kopi af a) ph.d.-bevis og b) kandidatbevis. Hvis ph.d.'en ikke er afsluttet, er en skriftlig udtalelse fra vejleder tilstrækkelig.
4. Publikationsliste.

Ansøgningsfrist: 25. november 2026, kl. 23.59 CET.

KU - SCIENCE - SNM forbeholder sig retten til ikke at behandle materiale modtaget efter fristen, samt ikke at behandle ansøgninger, der ikke opfylder ovennævnte krav.

Den videre proces

Efter ansøgningsfristens udløb udvælger den autoriserede rekrutteringsansvarlige ansøgere til bedømmelse efter indstilling fra ansættelsesudvalget. Alle ansøgere vil herefter straks blive informeret om, hvorvidt deres ansøgning er sendt til bedømmelse hos en uvildig bedømmer.

Når bedømmelsesarbejdet er afsluttet, har hver ansøger mulighed for at kommentere den del af bedømmelsen, der vedrører ansøgeren selv. Man kan læse om rekrutteringsprocessen på http://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/.

Ansøgeren vil blive bedømt i henhold til Bekendtgørelse nr. 242 af 13. marts 2012 om ansættelse af videnskabeligt personale ved universiteter. Københavns Universitet ønsker at afspejle samfundets mangfoldighed og opfordrer alle kvalificerede kandidater til at søge uanset personlig baggrund.