Postdoc in Microbial Single-Cell Genomics and Transcriptomics

Københavns Universitet, BRIC søger en postdoc til et 24-måneders forskningsprojekt. Dyk ned i mikrobiel single-cell genomik og transkriptomik – en unik mulighed for en nysgerrig forsker.

Postdoc in Microbial Single-Cell Genomics and Transcriptomics

Del :

FacebookTwitterLinkedIn

Københavns Universitet, BRIC indbyder til ansøgninger til en fuldtids postdoktorstilling af 24 måneders varighed i forskningsgruppen for Social Systems Microbiology ved Mikrobiologisk Sektion, Biologisk Institut, Københavns Universitet.

Projektets fokus vil være på single-cell transkriptomik og genomik af prokaryoter samt optimering af protokoller til at opnå ekstrachromosomale elementer og deres transkripter.

Projektet, postdoktoren skal arbejde på, er motiveret af en forståelse af fænotypisk heterogenitet i mikroorganismer: hvordan og hvorfor genetisk identiske celler danner distinkte fænotypiske subpopulationer, og hvilke mekanismer der giver anledning til denne diversitet.

Stillingen involverer deltagelse i et udforskende, metode-drevet projekt inden for dette område, finansieret af Villum Fonden. Arbejdet kombinerer udvikling af vådlaboratoriemetoder med sekventering og dataanalyse på tværs af en række bakterier og arkæer.

Projektet er grundforskning og åbent i sin udformning, og postdoktoren vil have betydelig frihed til at forme, hvordan metoder udvikles og anvendes. Derfor søger Københavns Universitet, BRIC en nysgerrig, drevet og kreativ forsker, der er motiveret af både metodeudvikling og opdagelse.

Dine opgaver
  • Dyrkning og arbejde med et mangfoldigt sæt bakterier og arkæer
  • Udvikling og optimering af protokoller til isolering og sekventering af ekstrachromosomalt DNA og associerede transkripter fra bakterier og arkæer
  • Anvendelse og tilpasning af single-cell transkriptomiske og genomiske tilgange til prokaryoter
  • Kvantificering af DNA og RNA ved hjælp af qPCR og digital PCR samt udførelse af bulk DNA- og RNA-sekventering
  • Analyse af sekventeringsdata, publicering af resultater og bidrag til gruppens videnskabelige miljø
Din profil
  • PhD i mikrobiologi, mikrobiel bioteknologi, molekylærbiologi eller et beslægtet felt
  • Praktisk erfaring med molekylære metoder og præparation af DNA- og/eller RNA-sekventeringsbiblioteker
  • Grundlæggende bioinformatiske færdigheder til analyse af sekventeringsdata (f.eks. i R eller Python)
  • Evne til at arbejde selvstændigt og samtidig samarbejde godt i et team
  • Fremragende skriftlig og mundtlig engelsk
  • Erfaring med prokaryotiske single-cell omics-metoder er en stor fordel
  • Erfaring med metodeudvikling, fejlfinding og tilpasning af protokoller er en stor fordel
  • Erfaring med dyrkning af diverse bakterier og/eller arkæer er en fordel

Københavns Universitet, BRIC tilbyder en international og samarbejdsorienteret forskningsgruppe, der studerer molekylærbiologi, økologi og evolution af bakterielle interaktioner. Gruppen er forankret i Mikrobiologisk Sektion med adgang til topmoderne faciliteter og et stærkt fokus på et fremragende arbejdsmiljø. Københavns Universitet, BRIC værdsætter ambitiøs videnskab lige så højt som en venlig, teamorienteret arbejdsplads.

Som ansat får du:
  • Et støttende, internationalt team, hvor ideer deles åbent
  • Et stærkt netværk af internationale og nationale samarbejdspartnere inden for og uden for mikrobiologi
  • Et aktivt socialt miljø med en kultur, der fremmer gensidig succes
  • Et miljø, der opfordrer til udvikling af egne forskningsidéer

Postdoktorens opgaver vil omfatte forskning inden for mikrobiel single-cell genomik og transkriptomik samt undervisning. Stillingen kan også omfatte udførelse af andre opgaver.

Yderligere information om instituttet findes via linket https://www1.bio.ku.dk. Forespørgsler om stillingen kan rettes til lektor Jonas Stenløkke Madsen (jsmadsen@bio.ku.dk).

Stillingen er ledig fra 01-02-2027 eller snarest muligt derefter.

Universitetet ønsker, at deres ansatte afspejler samfundets diversitet og byder derfor ansøgninger velkommen fra alle kvalificerede kandidater uanset personlig baggrund.

Ansættelsesvilkår

Stillingen er omfattet af aftalen om stillingsstruktur for videnskabeligt personale.

Ansættelse og aflønning sker i henhold til overenskomsten mellem Finansministeriet og Akademikerne i staten.

Forhandling om løntillæg er mulig.

Der kan læses mere om lønniveauer i den statslige sektor på www.loenoverblik.dk.

Ansøgningen, på engelsk, skal indsendes elektronisk.

Ansøgningen skal indeholde
  • Et følgebrev (maks. 1 side)
  • Curriculum vitae
  • Diplomer (master- og PhD-grad eller tilsvarende)
  • Komplet publikationsliste

Ansøgningsfristen er 19-11-2026, kl. 23:59 GMT +1.

Efter ansøgningsfristens udløb udvælger den autoriserede rekrutteringschef ansøgere til vurdering efter indstilling fra ansættelsesudvalget.

Information om rekrutteringsprocessen kan findes på https://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/.

Interviews vil blive afholdt i uge 50-51.

Oplysninger

Clock Icon
Arbejdstid full-time
Calendar Icon
Virksomhedens navn Københavns Universitet, BRIC
Location Icon
Adresse Ole Maaløes Vej 5, 2200, København N
Calendar Icon
Kontaktperson Jonas Stenløkke Madsen
Email Icon
Email jsmadsen@bio.ku.dk
phone Icon
Telefon +4535330140
Se stillingsopslag

Du finder virksomheden her

Ole Maaløes Vej 5, 2200, København N

Se større kort